Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSY4

CHCHD5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD5Q9BSY4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHCHD5Q9BSY4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms