Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSPG4P5Q96PW8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSPG4P5Q96PW8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms