Protein–RNA interactions for Protein: Q96NS8

CLUHP3, Putative protein CLUHP3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUHP3Q96NS8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CLUHP3Q96NS8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLUHP3Q96NS8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms