Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM87BQ96K49 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM87BQ96K49 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 441 ms