Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIC2Q96JB3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIC2Q96JB3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms