Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKD2Q969F2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKD2Q969F2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms