Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NSMCE1Q8WV22 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSMCE1Q8WV22 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms