Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU17

RNF139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF139Q8WU17 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF139Q8WU17 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF139Q8WU17 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF139Q8WU17 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF139Q8WU17 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF139Q8WU17 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF139Q8WU17 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF139Q8WU17 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF139Q8WU17 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF139Q8WU17 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF139Q8WU17 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF139Q8WU17 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF139Q8WU17 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF139Q8WU17 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF139Q8WU17 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF139Q8WU17 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF139Q8WU17 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms