Protein–RNA interactions for Protein: Q8NGK2

OR52B4, Olfactory receptor 52B4, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OR52B4Q8NGK2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
OR52B4Q8NGK2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
OR52B4Q8NGK2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms