Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC63Q8NA47 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC63Q8NA47 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms