Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNNM4Q6P4Q7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNNM4Q6P4Q7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms