Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LGALS9CQ6DKI2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms