Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPANXN1Q5VSR9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms