Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
KRTAP20-2Q3LI61 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
KRTAP20-2Q3LI61 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms