Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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TNXAQ16473 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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TNXAQ16473 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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TNXAQ16473 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNXAQ16473 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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TNXAQ16473 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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TNXAQ16473 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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TNXAQ16473 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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TNXAQ16473 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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TNXAQ16473 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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TNXAQ16473 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TNXAQ16473 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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