Protein–RNA interactions for Protein: Q156A1

ATXN8, Ataxin-8, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8Q156A1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATXN8Q156A1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ATXN8Q156A1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms