Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE1CQ14123 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE1CQ14123 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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