Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC2Q13868 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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