Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
KRR1Q13601 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRR1Q13601 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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