Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRSQ13332 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRSQ13332 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
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