Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BNIP1Q12981 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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BNIP1Q12981 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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BNIP1Q12981 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNIP1Q12981 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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