Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PTPN13Q12923 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PTPN13Q12923 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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