Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC173Q0VFZ6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC173Q0VFZ6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms