Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GABPB1Q06547 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GABPB1Q06547 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms