Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIM1P81133 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIM1P81133 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIM1P81133 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIM1P81133 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIM1P81133 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIM1P81133 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIM1P81133 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SIM1P81133 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIM1P81133 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIM1P81133 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SIM1P81133 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIM1P81133 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SIM1P81133 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIM1P81133 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIM1P81133 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIM1P81133 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIM1P81133 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIM1P81133 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIM1P81133 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIM1P81133 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIM1P81133 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SIM1P81133 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIM1P81133 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIM1P81133 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SIM1P81133 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIM1P81133 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIM1P81133 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SIM1P81133 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIM1P81133 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIM1P81133 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIM1P81133 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIM1P81133 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIM1P81133 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIM1P81133 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIM1P81133 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIM1P81133 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIM1P81133 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIM1P81133 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIM1P81133 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIM1P81133 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SIM1P81133 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIM1P81133 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIM1P81133 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIM1P81133 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIM1P81133 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIM1P81133 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIM1P81133 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIM1P81133 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SIM1P81133 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SIM1P81133 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIM1P81133 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIM1P81133 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIM1P81133 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIM1P81133 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIM1P81133 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIM1P81133 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIM1P81133 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIM1P81133 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIM1P81133 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIM1P81133 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIM1P81133 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SIM1P81133 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIM1P81133 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIM1P81133 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIM1P81133 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIM1P81133 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIM1P81133 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIM1P81133 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIM1P81133 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIM1P81133 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIM1P81133 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIM1P81133 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIM1P81133 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIM1P81133 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIM1P81133 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIM1P81133 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SIM1P81133 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIM1P81133 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIM1P81133 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SIM1P81133 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIM1P81133 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIM1P81133 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIM1P81133 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIM1P81133 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIM1P81133 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIM1P81133 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIM1P81133 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIM1P81133 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIM1P81133 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIM1P81133 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIM1P81133 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIM1P81133 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIM1P81133 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIM1P81133 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIM1P81133 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIM1P81133 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIM1P81133 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIM1P81133 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIM1P81133 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms