Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 COX6C-207ENST00000522934 562 ntTSL 48.04□□□□□ -1.122e-8■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 COX6C-206ENST00000520517 566 ntTSL 47.3□□□□□ -1.242e-8■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 TOP3B-205ENST00000434517 736 ntTSL 533.08■■■□□ 2.892e-6■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 TOP3B-211ENST00000449704 543 ntTSL 324.51■■□□□ 1.512e-6■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 TOP3B-204ENST00000430142 582 ntTSL 224.4■■□□□ 1.52e-6■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 TOP3B-207ENST00000437103 571 ntTSL 419.42■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 TOP3B-213ENST00000457179 3061 ntTSL 518.94■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 TOP3B-203ENST00000424393 824 ntTSL 517.12■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 TOP3B-212ENST00000456075 561 ntTSL 416.14■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 TOP3B-210ENST00000444502 4163 ntTSL 214.4□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 TOP3B-208ENST00000437929 550 ntTSL 411.3□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 HNMT-206ENST00000475675 743 ntTSL 313.49□□□□□ -0.251e-9■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.51e-9■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 HNMT-205ENST00000467390 532 ntTSL 25.63□□□□□ -1.511e-9■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 HNMT-208ENST00000485653 675 ntTSL 54.89□□□□□ -1.631e-9■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.641e-9■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 TLK1-208ENST00000466220 346 ntTSL 416.29■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 PTK2-255ENST00000524202 3014 ntTSL 1 (best)11.19□□□□□ -0.629e-7■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.222e-9■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 JPX-213ENST00000640437 1620 ntTSL 525.47■■□□□ 1.674e-7■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 JPX-207ENST00000602772 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.634e-7■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 JPX-205ENST00000602546 762 ntTSL 315.93■□□□□ 0.144e-7■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 JPX-208ENST00000602895 829 ntTSL 315.6■□□□□ 0.094e-7■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 JPX-209ENST00000602920 625 ntTSL 214.58□□□□□ -0.084e-7■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 JPX-201ENST00000414209 2194 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.264e-7■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 JPX-211ENST00000602985 476 ntTSL 312.75□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 JPX-204ENST00000602294 502 ntTSL 212.29□□□□□ -0.444e-7■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 JPX-210ENST00000602938 581 ntTSL 212.29□□□□□ -0.444e-7■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.964e-7■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 NDST1-206ENST00000522491 777 ntTSL 232.66■■■□□ 2.821e-6■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 NDST1-204ENST00000519157 576 ntTSL 531.67■■■□□ 2.661e-6■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 NDST1-208ENST00000524161 437 ntTSL 224.56■■□□□ 1.521e-6■■■■■ 28.8
HNRNPMP52272 NPRL3-205ENST00000457916 936 ntTSL 527.06■■□□□ 1.926e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 NPRL3-203ENST00000422814 512 ntTSL 427.06■■□□□ 1.926e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 NPRL3-213ENST00000621703 2812 ntTSL 1 (best)23.55■■□□□ 1.366e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.296e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 NPRL3-214ENST00000622194 2981 ntTSL 522.5■■□□□ 1.196e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 NPRL3-209ENST00000483663 932 ntTSL 320.3■□□□□ 0.846e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.846e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.776e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 NPRL3-207ENST00000468260 922 ntTSL 517.14■□□□□ 0.336e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 NPRL3-208ENST00000473674 855 ntTSL 317.13■□□□□ 0.336e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.662e-6■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.372e-6■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 HERPUD2-203ENST00000413517 808 ntTSL 513.56□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 HERPUD2-206ENST00000438224 811 ntTSL 313.56□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 HERPUD2-204ENST00000426180 757 ntTSL 58.83□□□□□ -12e-6■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 ANKRD12-205ENST00000546007 978 ntTSL 54.18□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 ANKRD12-202ENST00000359158 2250 ntTSL 22.22□□□□□ -2.051e-6■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 ZBTB8OS-208ENST00000468695 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 ZBTB8OS-214ENST00000492007 817 ntTSL 310.52□□□□□ -0.732e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 ZBTB8OS-215ENST00000498691 541 ntTSL 58.91□□□□□ -0.982e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 ZBTB8OS-211ENST00000476493 588 ntTSL 56.76□□□□□ -1.332e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 ZBTB8OS-207ENST00000467652 388 ntTSL 26.31□□□□□ -1.42e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 ZBTB8OS-203ENST00000373506 766 ntTSL 35.98□□□□□ -1.452e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.562e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.562e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 ZBTB8OS-209ENST00000473294 620 ntTSL 54.65□□□□□ -1.672e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 ZBTB8OS-204ENST00000436661 514 ntTSL 1 (best)4.11□□□□□ -1.752e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.762e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.177e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.117e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 PTPRA-208ENST00000455631 1107 ntTSL 538.03■■■■□ 3.684e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 PTPRA-207ENST00000431048 707 ntTSL 536.12■■■■□ 3.374e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 PTPRA-206ENST00000430705 733 ntTSL 526.22■■□□□ 1.794e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.274e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.494e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 PTPRA-202ENST00000318266 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.414e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 PTPRA-204ENST00000380393 3636 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.524e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 ANKRD11-207ENST00000562816 573 ntTSL 418.43■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.074e-8■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 SLC25A21-205ENST00000557611 591 ntTSL 521.2■□□□□ 0.984e-8■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 SLC25A21-201ENST00000331299 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.094e-8■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.219e-8■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.29e-8■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.129e-8■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.629e-8■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.349e-8■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.139e-8■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 CHTOP-206ENST00000495554 2553 ntTSL 220.89■□□□□ 0.939e-8■■■■■ 28.7
HNRNPMP52272 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 28.6
HNRNPMP52272 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 28.6
HNRNPMP52272 AHCTF1-202ENST00000366508 8751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.268e-7■■■■■ 28.6
HNRNPMP52272 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.177e-7■■■■■ 28.6
HNRNPMP52272 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.982e-7■■■■■ 28.6
HNRNPMP52272 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 231.02■■■□□ 2.562e-7■■■■■ 28.6
HNRNPMP52272 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.152e-7■■■■■ 28.6
HNRNPMP52272 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.562e-7■■■■■ 28.6
HNRNPMP52272 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.332e-7■■■■■ 28.6
HNRNPMP52272 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 28.6
HNRNPMP52272 OLA1-207ENST00000429575 485 ntTSL 37.15□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 28.6
HNRNPMP52272 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.461e-6■■■■■ 28.6
HNRNPMP52272 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.732e-6■■■■■ 28.6
HNRNPMP52272 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.422e-6■■■■■ 28.6
HNRNPMP52272 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 28.6
HNRNPMP52272 ERCC3-208ENST00000491292 4018 ntTSL 212.61□□□□□ -0.399e-7■■■■■ 28.6
HNRNPMP52272 GLUL-212ENST00000491322 6132 ntTSL 1 (best)12.54□□□□□ -0.48e-11■■■■■ 28.6
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 373.9 ms