Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRE11P49959 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRE11P49959 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRE11P49959 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRE11P49959 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRE11P49959 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRE11P49959 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRE11P49959 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRE11P49959 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRE11P49959 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRE11P49959 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRE11P49959 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRE11P49959 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRE11P49959 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRE11P49959 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRE11P49959 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRE11P49959 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRE11P49959 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRE11P49959 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRE11P49959 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRE11P49959 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRE11P49959 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRE11P49959 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRE11P49959 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRE11P49959 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRE11P49959 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRE11P49959 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRE11P49959 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRE11P49959 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRE11P49959 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRE11P49959 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRE11P49959 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRE11P49959 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRE11P49959 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRE11P49959 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRE11P49959 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRE11P49959 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRE11P49959 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRE11P49959 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRE11P49959 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRE11P49959 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRE11P49959 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRE11P49959 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRE11P49959 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRE11P49959 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRE11P49959 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRE11P49959 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRE11P49959 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRE11P49959 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRE11P49959 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRE11P49959 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRE11P49959 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MRE11P49959 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRE11P49959 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRE11P49959 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRE11P49959 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRE11P49959 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRE11P49959 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRE11P49959 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRE11P49959 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRE11P49959 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MRE11P49959 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MRE11P49959 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MRE11P49959 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MRE11P49959 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MRE11P49959 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRE11P49959 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRE11P49959 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRE11P49959 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRE11P49959 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRE11P49959 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRE11P49959 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRE11P49959 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRE11P49959 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRE11P49959 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRE11P49959 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRE11P49959 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRE11P49959 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRE11P49959 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRE11P49959 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRE11P49959 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRE11P49959 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRE11P49959 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRE11P49959 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRE11P49959 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRE11P49959 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRE11P49959 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRE11P49959 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRE11P49959 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MRE11P49959 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRE11P49959 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MRE11P49959 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRE11P49959 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRE11P49959 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRE11P49959 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRE11P49959 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRE11P49959 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRE11P49959 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRE11P49959 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRE11P49959 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms