Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPFP49454 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPFP49454 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPFP49454 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPFP49454 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPFP49454 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPFP49454 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPFP49454 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPFP49454 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPFP49454 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPFP49454 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPFP49454 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPFP49454 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPFP49454 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPFP49454 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPFP49454 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPFP49454 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPFP49454 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPFP49454 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPFP49454 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPFP49454 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPFP49454 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPFP49454 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPFP49454 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPFP49454 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPFP49454 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPFP49454 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPFP49454 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPFP49454 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPFP49454 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPFP49454 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPFP49454 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPFP49454 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPFP49454 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPFP49454 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPFP49454 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPFP49454 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPFP49454 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPFP49454 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPFP49454 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPFP49454 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPFP49454 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPFP49454 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPFP49454 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPFP49454 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPFP49454 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPFP49454 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPFP49454 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPFP49454 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPFP49454 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPFP49454 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPFP49454 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPFP49454 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPFP49454 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPFP49454 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPFP49454 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPFP49454 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPFP49454 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPFP49454 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPFP49454 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPFP49454 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPFP49454 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPFP49454 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPFP49454 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPFP49454 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPFP49454 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPFP49454 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPFP49454 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPFP49454 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPFP49454 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPFP49454 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPFP49454 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPFP49454 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPFP49454 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPFP49454 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPFP49454 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPFP49454 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPFP49454 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPFP49454 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPFP49454 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPFP49454 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPFP49454 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPFP49454 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPFP49454 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPFP49454 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPFP49454 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPFP49454 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPFP49454 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPFP49454 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPFP49454 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPFP49454 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPFP49454 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPFP49454 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPFP49454 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPFP49454 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPFP49454 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPFP49454 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPFP49454 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPFP49454 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPFP49454 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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