Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BMI1P35226 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BMI1P35226 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BMI1P35226 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BMI1P35226 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BMI1P35226 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BMI1P35226 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BMI1P35226 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
BMI1P35226 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
BMI1P35226 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BMI1P35226 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BMI1P35226 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
BMI1P35226 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BMI1P35226 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BMI1P35226 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BMI1P35226 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BMI1P35226 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BMI1P35226 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BMI1P35226 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BMI1P35226 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BMI1P35226 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BMI1P35226 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
BMI1P35226 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
BMI1P35226 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BMI1P35226 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BMI1P35226 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BMI1P35226 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BMI1P35226 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BMI1P35226 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BMI1P35226 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BMI1P35226 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BMI1P35226 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BMI1P35226 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BMI1P35226 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BMI1P35226 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BMI1P35226 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BMI1P35226 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BMI1P35226 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BMI1P35226 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BMI1P35226 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BMI1P35226 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BMI1P35226 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BMI1P35226 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BMI1P35226 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BMI1P35226 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BMI1P35226 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BMI1P35226 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BMI1P35226 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BMI1P35226 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BMI1P35226 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BMI1P35226 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BMI1P35226 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BMI1P35226 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BMI1P35226 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BMI1P35226 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BMI1P35226 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BMI1P35226 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BMI1P35226 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BMI1P35226 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BMI1P35226 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BMI1P35226 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BMI1P35226 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BMI1P35226 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BMI1P35226 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BMI1P35226 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BMI1P35226 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BMI1P35226 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BMI1P35226 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BMI1P35226 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BMI1P35226 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BMI1P35226 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BMI1P35226 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BMI1P35226 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BMI1P35226 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BMI1P35226 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BMI1P35226 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BMI1P35226 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BMI1P35226 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BMI1P35226 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BMI1P35226 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BMI1P35226 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BMI1P35226 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BMI1P35226 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BMI1P35226 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BMI1P35226 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BMI1P35226 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BMI1P35226 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BMI1P35226 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BMI1P35226 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BMI1P35226 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BMI1P35226 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BMI1P35226 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BMI1P35226 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BMI1P35226 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BMI1P35226 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BMI1P35226 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BMI1P35226 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BMI1P35226 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BMI1P35226 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BMI1P35226 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms