Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKACBP22694 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKACBP22694 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKACBP22694 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKACBP22694 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKACBP22694 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKACBP22694 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRKACBP22694 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRKACBP22694 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRKACBP22694 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRKACBP22694 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRKACBP22694 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRKACBP22694 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRKACBP22694 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRKACBP22694 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRKACBP22694 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRKACBP22694 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRKACBP22694 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRKACBP22694 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRKACBP22694 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRKACBP22694 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKACBP22694 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms