Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HOXA5P20719 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA5P20719 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms