Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP1A3P13637 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATP1A3P13637 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A3P13637 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A3P13637 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A3P13637 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A3P13637 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A3P13637 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A3P13637 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A3P13637 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP1A3P13637 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A3P13637 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A3P13637 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A3P13637 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A3P13637 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A3P13637 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A3P13637 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP1A3P13637 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms