Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RLBP1P12271 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RLBP1P12271 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RLBP1P12271 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms