Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RD3LP0DJH9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RD3LP0DJH9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms