Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDKL5O76039 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDKL5O76039 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms