Protein–RNA interactions for Protein: O75185

ATP2C2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C2O75185 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C2O75185 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C2O75185 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C2O75185 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C2O75185 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C2O75185 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C2O75185 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C2O75185 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C2O75185 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C2O75185 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2C2O75185 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP2C2O75185 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP2C2O75185 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP2C2O75185 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2C2O75185 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2C2O75185 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2C2O75185 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2C2O75185 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms