Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF839A8K0R7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms