Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP27XA6NNY8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP27XA6NNY8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms