Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SERINC4A6NH21 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SERINC4A6NH21 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms