Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NDN8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NDN8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NDN8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NDN8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NDN8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NDN8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NDN8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NDN8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NDN8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NDN8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NDN8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NDN8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NDN8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NDN8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NDN8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NDN8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NDN8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NDN8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NDN8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NDN8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NDN8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A6NDN8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A6NDN8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A6NDN8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A6NDN8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A6NDN8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A6NDN8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A6NDN8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A6NDN8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A6NDN8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A6NDN8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A6NDN8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A6NDN8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A6NDN8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A6NDN8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A6NDN8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A6NDN8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A6NDN8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
A6NDN8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
A6NDN8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
A6NDN8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A6NDN8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A6NDN8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A6NDN8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A6NDN8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A6NDN8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A6NDN8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A6NDN8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A6NDN8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A6NDN8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A6NDN8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
A6NDN8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A6NDN8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
A6NDN8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A6NDN8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A6NDN8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A6NDN8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A6NDN8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A6NDN8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A6NDN8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A6NDN8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A6NDN8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
A6NDN8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A6NDN8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
A6NDN8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A6NDN8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
A6NDN8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
A6NDN8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms