Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A0A0J9YXV3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YXV3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms