Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 NDUFB8-203ENST00000370322 713 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 LINC01556-201ENST00000377186 466 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 MIR219A2-202ENST00000385220 97 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 CST13P-202ENST00000400563 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AL139156.2-201ENST00000414059 340 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AL592463.1-201ENST00000451108 635 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AL133297.2-201ENST00000563162 485 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AC004702.1-201ENST00000580225 195 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 ZNF670-201ENST00000366503 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 KLHDC2-211ENST00000557247 1565 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 PRPSAP2-228ENST00000610773 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 FAM9A-201ENST00000381003 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 NBEAP3-201ENST00000420638 1493 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 LILRA2-202ENST00000251377 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 CCDC33-201ENST00000268082 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 TNFSF13B-202ENST00000430559 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PCYT1B-202ENST00000379144 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 SOCS2-AS1-201ENST00000499137 3325 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 KRBOX4-203ENST00000377919 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 LINC00963-216ENST00000623185 786 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC109635.4-201ENST00000636653 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 RALYL-201ENST00000517638 1972 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AL354704.1-201ENST00000629369 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PRAMENP-201ENST00000337471 3038 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PTPRJQ12913 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 JPT2-206ENST00000562684 3185 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 AC004554.2-201ENST00000634846 1893 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 GRAMD1B-203ENST00000456860 2805 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 CELF2-210ENST00000631816 1803 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PTPRJQ12913 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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