Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MFAP3L-201ENST00000361618 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 NNMT-201ENST00000299964 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CTLA4-202ENST00000302823 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 B3GALT5-204ENST00000398714 2341 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 FKBP4-201ENST00000001008 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 LAMB1-204ENST00000393561 5766 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SPATS2L-208ENST00000409718 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 PRICKLE1-209ENST00000552240 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 NNT-202ENST00000344920 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 STX16-205ENST00000361830 4318 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 RBM3-201ENST00000354480 1884 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 PDE6B-212ENST00000496514 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 C1S-203ENST00000402681 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 LHFPL5-201ENST00000360215 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TYRO3P-201ENST00000558165 2705 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 EFL1-201ENST00000268206 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 FN1-212ENST00000446046 7952 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SORL1-201ENST00000260197 10904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SHANK2-AS3-201ENST00000307548 1683 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 C3orf36-201ENST00000408895 1668 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 BRD1-203ENST00000404760 4550 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 UBA3-202ENST00000361055 2154 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 RAET1K-202ENST00000533735 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ZNF155-207ENST00000590615 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 RNA5SP248-201ENST00000365602 127 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 RBMXP2-201ENST00000434705 1168 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 IL16-203ENST00000394652 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MEI1-201ENST00000401548 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CXorf40A-203ENST00000422892 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 NEXMIF-201ENST00000055682 11719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 BCAS3-222ENST00000589222 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CASP7-210ENST00000614447 2555 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ARHGAP27-202ENST00000376922 3628 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 RABL2B-203ENST00000395591 1987 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ZNF132-201ENST00000254166 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ARPC5-202ENST00000359856 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CWC22-202ENST00000410053 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 DIAPH3-205ENST00000400324 4804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 IKZF4-201ENST00000262032 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 NDRG4-203ENST00000394279 3431 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 WDR47-203ENST00000369962 4199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC026369.1-202ENST00000508953 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 PCSK9-201ENST00000302118 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 BCO2-202ENST00000361053 1868 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 GABBR1-203ENST00000377012 4104 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AL118508.3-201ENST00000623468 1854 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MBTPS1-201ENST00000343411 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 RNF4-201ENST00000314289 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 GRM3-203ENST00000439827 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 PKD2L1-201ENST00000318222 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MSR1-205ENST00000445506 1513 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ATP2C2-201ENST00000262429 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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