Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APEX2Q9UBZ4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APEX2Q9UBZ4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms