Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DKK2Q9UBU2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKK2Q9UBU2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms