Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD2Q9UBB5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD2Q9UBB5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms