Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHD7Q9P2D1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms