Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR8

ING3, Inhibitor of growth protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING3Q9NXR8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ING3Q9NXR8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ING3Q9NXR8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms