Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 MRPL16-202ENST00000525470 922 ntTSL 54.49□□□□□ -1.698e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.828e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.068e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 CEP44-208ENST00000508483 864 ntTSL 41.34□□□□□ -2.198e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC1.14□□□□□ -2.238e-8■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 HMGCR-201ENST00000287936 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 HMGCR-202ENST00000343975 3681 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.071e-7■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.281e-7■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 HMGCR-204ENST00000504466 1107 ntTSL 25.22□□□□□ -1.571e-7■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 RB1CC1-206ENST00000518710 711 ntTSL 326.1■■□□□ 1.773e-7■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 RB1CC1-208ENST00000521611 528 ntTSL 522.24■■□□□ 1.153e-7■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.753e-7■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 RB1CC1-203ENST00000517963 551 ntTSL 417.85■□□□□ 0.453e-7■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 RB1CC1-204ENST00000518211 891 ntTSL 517.57■□□□□ 0.43e-7■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 C1orf52-202ENST00000344356 504 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 C1orf52-204ENST00000493514 631 ntTSL 1 (best)11.28□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 C1orf52-201ENST00000294661 3391 ntTSL 1 (best)10.25□□□□□ -0.773e-7■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 XRCC2-201ENST00000359321 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.853e-7■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 XRCC2-202ENST00000495707 4728 ntTSL 1 (best)9.67□□□□□ -0.863e-7■■■■■ 33.3
RBM22Q9NW64 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.512e-17■■■■■ 33.2
RBM22Q9NW64 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.012e-17■■■■■ 33.2
RBM22Q9NW64 EEF1A1-207ENST00000490569 1802 ntTSL 56.83□□□□□ -1.325e-8■■■■■ 33.2
RBM22Q9NW64 EEF1A1-208ENST00000491404 633 ntTSL 33.59□□□□□ -1.835e-8■■■■■ 33.2
RBM22Q9NW64 HAGH-211ENST00000569339 820 ntTSL 324.51■■□□□ 1.511e-11■■■■■ 33.2
RBM22Q9NW64 HAGH-212ENST00000569700 1156 ntTSL 1 (best)19.25■□□□□ 0.671e-11■■■■■ 33.2
RBM22Q9NW64 MAP4K4-211ENST00000427603 526 ntTSL 49.74□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 33.2
RBM22Q9NW64 DNM2-218ENST00000591701 863 ntTSL 313.89□□□□□ -0.194e-29■■■■■ 33.2
RBM22Q9NW64 DNM2-210ENST00000587830 868 ntTSL 511.28□□□□□ -0.64e-29■■■■■ 33.2
RBM22Q9NW64 HNRNPH1-231ENST00000519033 832 ntTSL 317.19■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 33.2
RBM22Q9NW64 ATXN2L-221ENST00000566946 2162 ntTSL 1 (best)20.84■□□□□ 0.939e-13■■■■■ 33.2
RBM22Q9NW64 ATXN2L-208ENST00000562583 1933 ntTSL 1 (best)18.29■□□□□ 0.529e-13■■■■■ 33.2
RBM22Q9NW64 ATXN2L-213ENST00000564162 770 ntTSL 517.26■□□□□ 0.351e-23■■■■■ 33.2
RBM22Q9NW64 ATXN2L-219ENST00000566007 471 ntTSL 39.04□□□□□ -0.961e-23■■■■■ 33.2
RBM22Q9NW64 ATP6V0A1-212ENST00000587375 546 ntTSL 48.3□□□□□ -1.082e-12■■■■■ 33.2
RBM22Q9NW64 ATP6V0A1-208ENST00000586001 587 ntTSL 36.39□□□□□ -1.392e-12■■■■■ 33.2
RBM22Q9NW64 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 33.2
RBM22Q9NW64 DHX9-203ENST00000474446 848 ntTSL 35.25□□□□□ -1.578e-8■■■■■ 33.1
RBM22Q9NW64 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.432e-10■■■■■ 33.1
RBM22Q9NW64 PDK1-205ENST00000431718 728 ntTSL 321.03■□□□□ 0.962e-18■■■■■ 33
RBM22Q9NW64 PDK1-208ENST00000443353 842 ntTSL 210.3□□□□□ -0.762e-18■■■■■ 33
RBM22Q9NW64 PDK1-206ENST00000436490 571 ntTSL 57.45□□□□□ -1.222e-18■■■■■ 33
RBM22Q9NW64 PDK1-204ENST00000416991 699 ntTSL 53.75□□□□□ -1.812e-18■■■■■ 33
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RBM22Q9NW64 FNBP4-201ENST00000263773 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.461e-9■■■■■ 33
RBM22Q9NW64 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.235e-8■■■■■ 32.9
RBM22Q9NW64 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.145e-8■■■■■ 32.9
RBM22Q9NW64 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.165e-8■■■■■ 32.9
RBM22Q9NW64 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.335e-8■■■■■ 32.9
RBM22Q9NW64 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.427e-7■■■■■ 32.9
RBM22Q9NW64 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.457e-7■■■■■ 32.9
RBM22Q9NW64 POLE-210ENST00000537064 8011 ntTSL 1 (best)10.77□□□□□ -0.697e-7■■■■■ 32.9
RBM22Q9NW64 ADGRV1-217ENST00000639431 611 ntTSL 55.02□□□□□ -1.616e-7■■■■■ 32.9
RBM22Q9NW64 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.456e-17■■■■■ 32.9
RBM22Q9NW64 RPS12-202ENST00000484616 639 ntTSL 22.91□□□□□ -1.946e-17■■■■■ 32.9
RBM22Q9NW64 EEF1A1-209ENST00000495333 958 ntTSL 56.53□□□□□ -1.365e-8■■■■■ 32.9
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RBM22Q9NW64 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.261e-8■■■■■ 32.8
RBM22Q9NW64 GUSBP11-204ENST00000451837 3234 ntTSL 1 (best)15.58■□□□□ 0.091e-8■■■■■ 32.8
RBM22Q9NW64 AP000347.2-203ENST00000434893 403 ntTSL 215.38■□□□□ 0.051e-8■■■■■ 32.8
RBM22Q9NW64 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.191e-8■■■■■ 32.8
RBM22Q9NW64 GUSBP11-203ENST00000445682 3350 ntTSL 213.04□□□□□ -0.321e-8■■■■■ 32.8
RBM22Q9NW64 AP000347.2-201ENST00000423913 584 ntTSL 511.08□□□□□ -0.641e-8■■■■■ 32.8
RBM22Q9NW64 TNS3-205ENST00000434451 560 ntTSL 516.63■□□□□ 0.254e-14■■■■■ 32.8
RBM22Q9NW64 TNS3-203ENST00000415929 570 ntTSL 412.26□□□□□ -0.454e-14■■■■■ 32.8
RBM22Q9NW64 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.063e-6■■■■■ 32.8
RBM22Q9NW64 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.613e-6■■■■■ 32.8
RBM22Q9NW64 FRAS1-201ENST00000325942 7142 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.855e-7■■■■■ 32.8
RBM22Q9NW64 FRAS1-206ENST00000510944 2125 ntTSL 29.34□□□□□ -0.915e-7■■■■■ 32.8
RBM22Q9NW64 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.55e-7■■■■■ 32.8
RBM22Q9NW64 USP7-203ENST00000542333 1966 ntTSL 29.34□□□□□ -0.917e-8■■■■■ 32.7
RBM22Q9NW64 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.132e-6■■■■■ 32.7
RBM22Q9NW64 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.132e-6■■■■■ 32.7
RBM22Q9NW64 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.312e-6■■■■■ 32.7
RBM22Q9NW64 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.265e-6■■■■■ 32.6
RBM22Q9NW64 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.911e-7■■■■■ 32.6
RBM22Q9NW64 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 32.6
RBM22Q9NW64 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 32.6
RBM22Q9NW64 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 32.6
RBM22Q9NW64 ATXN2L-218ENST00000565971 3264 ntTSL 1 (best)14.56□□□□□ -0.084e-7■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.676e-9■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 SMARCC1-202ENST00000425518 3827 ntTSL 27.59□□□□□ -1.196e-9■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 SMARCC1-204ENST00000462198 785 ntTSL 25.9□□□□□ -1.462e-7■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 SMARCC1-206ENST00000485737 631 ntTSL 44.6□□□□□ -1.672e-7■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 ASL-209ENST00000493708 885 ntTSL 325.66■■□□□ 1.73e-6■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.13e-6■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.583e-6■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.423e-6■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.333e-6■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 ASL-208ENST00000488343 198 ntTSL 315.85■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 ASL-206ENST00000464970 640 ntTSL 315.82■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 AC068533.4-201ENST00000450043 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.853e-6■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 ABL1-202ENST00000372348 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 CLASP2-209ENST00000468888 6978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 32.5
RBM22Q9NW64 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 32.5
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