Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC39A9Q9NUM3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms